Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zkscan4Q5SZT6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zkscan4Q5SZT6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms