Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQF8

Sap30l, Histone deacetylase complex subunit SAP30L, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30lQ5SQF8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sap30lQ5SQF8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms