Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q5EBG8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q5EBG8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q5EBG8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q5EBG8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q5EBG8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q5EBG8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q5EBG8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q5EBG8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q5EBG8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q5EBG8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms