Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms