Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Znf48Q3US17 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Znf48Q3US17 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Znf48Q3US17 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Znf48Q3US17 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Znf48Q3US17 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Znf48Q3US17 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Znf48Q3US17 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Znf48Q3US17 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Znf48Q3US17 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Znf48Q3US17 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf48Q3US17 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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