Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms