Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UPC7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UPC7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UPC7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UPC7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UPC7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UPC7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UPC7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UPC7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UPC7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UPC7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3UPC7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms