Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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