Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
YrdcQ3U5F4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
YrdcQ3U5F4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
YrdcQ3U5F4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
YrdcQ3U5F4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
YrdcQ3U5F4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
YrdcQ3U5F4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
YrdcQ3U5F4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
YrdcQ3U5F4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
YrdcQ3U5F4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
YrdcQ3U5F4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
YrdcQ3U5F4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
YrdcQ3U5F4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
YrdcQ3U5F4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
YrdcQ3U5F4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
YrdcQ3U5F4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
YrdcQ3U5F4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
YrdcQ3U5F4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms