Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms