Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms