Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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