Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 PRM7YDL039C 2097 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YDR102CYDR102C 333 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 SUR2YDR297W 1050 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YGR153WYGR153W 654 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 FMC1YIL098C 468 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 snR36snR36 182 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 MBA1YBR185C 837 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 SAC1YKL212W 1872 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 KRE6YPR159W 2163 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 SSF1YHR066W 1362 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 GCN20YFR009W 2259 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YHR182WYHR182W 2358 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 SUM1YDR310C 3189 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 ESF1YDR365C 1887 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 HRK1YOR267C 2280 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 snR80snR80 171 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 GRX4YER174C 735 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 COX4YGL187C 468 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 TDA8YAL064C-A 381 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 ISF1YMR081C 1017 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 THI12YNL332W 1023 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 GRE2YOL151W 1029 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 VAM10YOR068C 345 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 STE20YHL007C 2820 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 MNT2YGL257C 1677 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 PEP7YDR323C 1548 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 CAF4YKR036C 1932 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 MCM4YPR019W 2802 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 AVT7YIL088C 1473 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 TUP1YCR084C 2142 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YEL067CYEL067C 588 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 RNR4YGR180C 1038 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 PCL5YHR071W 690 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 RGI2YIL057C 495 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YJL015CYJL015C 285 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YJR085CYJR085C 318 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 MIM2YLR099W-A 264 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YNL205CYNL205C 423 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 DCS2YOR173W 1062 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 PHO84YML123C 1764 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 URC2YDR520C 2319 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 TPD3YAL016W 1908 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 TRF5YNL299W 1929 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 PRP3YDR473C 1410 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 CTM1YHR109W 1758 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YOR022CYOR022C 2148 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 RPL1BYGL135W 654 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YAL004WYAL004W 648 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 IDP2YLR174W 1239 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 HTA2YBL003C 399 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 RAD14YMR201C 1116 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 TIM18YOR297C 579 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 RPL1AYPL220W 654 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YPR099CYPR099C 357 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 ARC40YBR234C 1155 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 TGL3YMR313C 1929 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 SEC39YLR440C 2130 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 BI4Q0120 1917 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 TDA7YNL176C 1911 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 CRT10YOL063C 2874 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 LHP1YDL051W 828 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YDR090CYDR090C 933 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 AST2YER101C 1293 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 EFB1YAL003W 621 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 EMC2YJR088C 879 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YJR003CYJR003C 1560 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 DNF2YDR093W 4839 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YAP1YML007W 1953 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 GPI17YDR434W 1605 nt4.46□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 STP2YHR006W 1626 nt4.46□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 SEC59YMR013C 1560 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 YFL015CYFL015C 495 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 CGR1YGL029W 363 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 PFD1YJL179W 330 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 YAL037WYAL037W 804 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 RMP1YLR145W 606 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 BET5YML077W 480 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 RPS16AYMR143W 432 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 ZEO1YOL109W 342 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 BRE5YNR051C 1548 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 FRS1YLR060W 1788 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 PRS5YOL061W 1491 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 MEF2YJL102W 2460 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 THI13YDL244W 1023 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 CPR5YDR304C 678 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 SMX2YFL017W-A 234 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 RPL19BYBL027W 570 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 YOR082CYOR082C 342 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 ASK10YGR097W 3441 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 BOI2YER114C 3123 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 YDL068WYDL068W 330 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 YRB1YDR002W 606 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1A-NL1Q12391 YDR262WYDR262W 819 nt4.44□□□□□ -1.7
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