Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
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Ttc39dQ0VF76 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Ttc39dQ0VF76 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Ttc39dQ0VF76 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Ttc39dQ0VF76 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Ttc39dQ0VF76 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Ttc39dQ0VF76 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Ttc39dQ0VF76 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Ttc39dQ0VF76 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Ttc39dQ0VF76 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms