Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms