Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 MPS2YGL075C 1164 nt2.33□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 RGI2YIL057C 495 nt2.33□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 INP52YNL106C 3552 nt2.33□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 SST2YLR452C 2097 nt2.33□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 FRE2YKL220C 2136 nt2.33□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 FKS3YMR306W 5358 nt2.33□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 CDC20YGL116W 1833 nt2.33□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.32□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 PUF6YDR496C 1971 nt2.32□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 PTP3YER075C 2787 nt2.32□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt2.32□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 RNR2YJL026W 1200 nt2.32□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 IRC14YOR135C 342 nt2.32□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 EAP1YKL204W 1899 nt2.32□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 ENP2YGR145W 2124 nt2.32□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 RSN1YMR266W 2862 nt2.31□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 PFF1YBR074W 2931 nt2.31□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 NUM1YDR150W 8247 nt2.31□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YPR1YDR368W 939 nt2.31□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt2.31□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 RPB9YGL070C 369 nt2.31□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YLR230WYLR230W 306 nt2.31□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 NNT1YLR285W 786 nt2.31□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YNL203CYNL203C 612 nt2.31□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YOL166CYOL166C 339 nt2.31□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YPL276WYPL276W 438 nt2.31□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 RIT1YMR283C 1542 nt2.31□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 MED1YPR070W 1701 nt2.31□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt2.3□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 VMA8YEL051W 771 nt2.3□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YGR160WYGR160W 612 nt2.3□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 ARC19YKL013C 516 nt2.3□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 IZH4YOL101C 939 nt2.3□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 PBP2YBR233W 1242 nt2.3□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 APC5YOR249C 2058 nt2.3□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 PDR3YBL005W 2931 nt2.3□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 IRA2YOL081W 9240 nt2.3□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 PDR1YGL013C 3207 nt2.29□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YCK2YNL154C 1641 nt2.29□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 KAR5YMR065W 1515 nt2.29□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 PET100YDR079W 336 nt2.29□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 PEX14YGL153W 1026 nt2.29□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YIP5YGL161C 933 nt2.29□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 PRP18YGR006W 756 nt2.29□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YGR018CYGR018C 330 nt2.29□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 NDL1YLR254C 570 nt2.29□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 PSY3YLR376C 729 nt2.29□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 BET5YML077W 480 nt2.29□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YNL171CYNL171C 369 nt2.29□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 RPL23AYBL087C 414 nt2.29□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YOR203WYOR203W 354 nt2.29□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 AI2Q0055 2565 nt2.29□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 PSK1YAL017W 4071 nt2.29□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 PBS2YJL128C 2007 nt2.29□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YKL100CYKL100C 1764 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 AYT1YLL063C 1425 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YJL132WYJL132W 2253 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 RRP14YKL082C 1305 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 snR70snR70 164 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 SAW1YAL027W 786 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YJR071WYJR071W 369 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 HAA1YPR008W 2085 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 ESL1YIL151C 3357 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 CWH41YGL027C 2502 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 YCL019WYCL019W 5313 nt2.28□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 BUB1YGR188C 3066 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 SKO1YNL167C 1944 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 BNA4YBL098W 1383 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 KRE2YDR483W 1329 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 SRP68YPL243W 1800 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 TOR1YJR066W 7413 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YHR213WYHR213W 597 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YJR020WYJR020W 333 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YKL066WYKL066W 444 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 MRPL38YKL170W 417 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 OMA1YKR087C 1038 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YAR062WYAR062W 597 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 SWD3YBR175W 948 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 CTP1YBR291C 900 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 RRP7YCL031C 894 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 DBP7YKR024C 2229 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 DSE4YNR067C 3354 nt2.27□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 CDC5YMR001C 2118 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 RRI1YDL216C 1323 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 TCA17YEL048C 459 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 COBQ0105 1158 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 MRPL9YGR220C 810 nt2.26□□□□□ -2.05
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