Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff1Q08423 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff1Q08423 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff1Q08423 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff1Q08423 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff1Q08423 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff1Q08423 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff1Q08423 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff1Q08423 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff1Q08423 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff1Q08423 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff1Q08423 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff1Q08423 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff1Q08423 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff1Q08423 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms