Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms