Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms