Protein–RNA interactions for Protein: Q06180

Ptpn2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn2Q06180 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn2Q06180 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptpn2Q06180 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms