Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl7Q03366 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms