Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms