Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms