Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MC1RQ01726 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms