Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Serpina1cQ00896 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Serpina1cQ00896 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Serpina1cQ00896 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms