Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms