Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms