Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx4P70452 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx4P70452 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx4P70452 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx4P70452 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx4P70452 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms