Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp1P58466 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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