Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtnsP57757 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtnsP57757 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtnsP57757 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtnsP57757 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CtnsP57757 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CtnsP57757 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtnsP57757 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CtnsP57757 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms