Protein–RNA interactions for Protein: P56942

Pmch, Pro-MCH, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmchP56942 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PmchP56942 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PmchP56942 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PmchP56942 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PmchP56942 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PmchP56942 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PmchP56942 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PmchP56942 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PmchP56942 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PmchP56942 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PmchP56942 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PmchP56942 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PmchP56942 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PmchP56942 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PmchP56942 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PmchP56942 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PmchP56942 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PmchP56942 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PmchP56942 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PmchP56942 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PmchP56942 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PmchP56942 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmchP56942 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmchP56942 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmchP56942 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmchP56942 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmchP56942 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmchP56942 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmchP56942 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmchP56942 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmchP56942 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmchP56942 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmchP56942 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmchP56942 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmchP56942 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmchP56942 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmchP56942 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmchP56942 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmchP56942 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmchP56942 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmchP56942 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmchP56942 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmchP56942 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmchP56942 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmchP56942 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmchP56942 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmchP56942 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
PmchP56942 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PmchP56942 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PmchP56942 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PmchP56942 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmchP56942 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PmchP56942 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PmchP56942 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmchP56942 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PmchP56942 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PmchP56942 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmchP56942 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmchP56942 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PmchP56942 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmchP56942 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmchP56942 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmchP56942 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmchP56942 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmchP56942 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmchP56942 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmchP56942 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmchP56942 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmchP56942 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmchP56942 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmchP56942 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmchP56942 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PmchP56942 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmchP56942 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmchP56942 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmchP56942 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmchP56942 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmchP56942 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmchP56942 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmchP56942 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PmchP56942 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PmchP56942 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms