Protein–RNA interactions for Protein: P55292

Dsc2, Desmocollin-2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc2P55292 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsc2P55292 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms