Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPP55072 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPP55072 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPP55072 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPP55072 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPP55072 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPP55072 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPP55072 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPP55072 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPP55072 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPP55072 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPP55072 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPP55072 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPP55072 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPP55072 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPP55072 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPP55072 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPP55072 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPP55072 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPP55072 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPP55072 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPP55072 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPP55072 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPP55072 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPP55072 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPP55072 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPP55072 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPP55072 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPP55072 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPP55072 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPP55072 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPP55072 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPP55072 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPP55072 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPP55072 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPP55072 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPP55072 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPP55072 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPP55072 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPP55072 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPP55072 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPP55072 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPP55072 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPP55072 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPP55072 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPP55072 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPP55072 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPP55072 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPP55072 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPP55072 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPP55072 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPP55072 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPP55072 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPP55072 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPP55072 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPP55072 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCPP55072 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCPP55072 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCPP55072 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCPP55072 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCPP55072 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCPP55072 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCPP55072 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCPP55072 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCPP55072 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCPP55072 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCPP55072 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCPP55072 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCPP55072 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPP55072 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPP55072 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPP55072 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPP55072 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPP55072 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPP55072 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPP55072 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPP55072 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPP55072 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPP55072 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPP55072 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPP55072 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPP55072 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPP55072 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPP55072 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPP55072 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPP55072 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPP55072 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPP55072 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPP55072 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPP55072 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPP55072 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPP55072 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPP55072 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPP55072 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPP55072 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPP55072 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPP55072 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPP55072 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPP55072 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPP55072 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms