Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms