Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FmodP50608 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FmodP50608 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FmodP50608 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FmodP50608 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FmodP50608 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FmodP50608 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FmodP50608 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FmodP50608 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FmodP50608 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FmodP50608 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FmodP50608 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FmodP50608 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FmodP50608 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FmodP50608 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FmodP50608 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FmodP50608 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FmodP50608 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FmodP50608 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FmodP50608 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FmodP50608 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FmodP50608 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FmodP50608 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FmodP50608 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FmodP50608 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FmodP50608 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms