Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod1P49813 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms