Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ercc3P49135 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms