Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms