Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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