Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms