Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms