Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxraP28700 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxraP28700 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxraP28700 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxraP28700 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxraP28700 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxraP28700 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxraP28700 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxraP28700 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxraP28700 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RxraP28700 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxraP28700 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxraP28700 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxraP28700 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RxraP28700 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxraP28700 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxraP28700 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxraP28700 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxraP28700 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxraP28700 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxraP28700 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RxraP28700 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxraP28700 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxraP28700 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxraP28700 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxraP28700 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxraP28700 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxraP28700 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxraP28700 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxraP28700 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxraP28700 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxraP28700 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxraP28700 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxraP28700 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RxraP28700 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxraP28700 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxraP28700 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxraP28700 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RxraP28700 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxraP28700 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RxraP28700 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxraP28700 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxraP28700 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxraP28700 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxraP28700 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxraP28700 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxraP28700 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxraP28700 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxraP28700 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RxraP28700 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RxraP28700 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxraP28700 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxraP28700 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxraP28700 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxraP28700 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxraP28700 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxraP28700 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxraP28700 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RxraP28700 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxraP28700 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxraP28700 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxraP28700 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxraP28700 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxraP28700 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxraP28700 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxraP28700 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxraP28700 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxraP28700 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxraP28700 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxraP28700 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxraP28700 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxraP28700 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxraP28700 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxraP28700 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxraP28700 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxraP28700 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxraP28700 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RxraP28700 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxraP28700 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms