Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpbP27790 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpbP27790 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpbP27790 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpbP27790 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms