Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpbP27048 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms