Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NdnP25233 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NdnP25233 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NdnP25233 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NdnP25233 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NdnP25233 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NdnP25233 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NdnP25233 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NdnP25233 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NdnP25233 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NdnP25233 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NdnP25233 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NdnP25233 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NdnP25233 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NdnP25233 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NdnP25233 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NdnP25233 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NdnP25233 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NdnP25233 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NdnP25233 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NdnP25233 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NdnP25233 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NdnP25233 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NdnP25233 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NdnP25233 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NdnP25233 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NdnP25233 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NdnP25233 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NdnP25233 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NdnP25233 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NdnP25233 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NdnP25233 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NdnP25233 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NdnP25233 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NdnP25233 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NdnP25233 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NdnP25233 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NdnP25233 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NdnP25233 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NdnP25233 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NdnP25233 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NdnP25233 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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