Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ggta1P23336 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms