Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms