Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18530 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18530 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18530 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18530 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18530 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P18530 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18530 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18530 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18530 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18530 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P18530 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18530 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18530 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18530 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18530 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18530 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18530 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18530 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18530 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18530 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18530 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18530 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18530 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18530 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18530 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18530 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18530 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P18530 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18530 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18530 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18530 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18530 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18530 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18530 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P18530 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18530 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18530 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18530 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P18530 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18530 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18530 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18530 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms