Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18528 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18528 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18528 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18528 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18528 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18528 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18528 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18528 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18528 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18528 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18528 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18528 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18528 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18528 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18528 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18528 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18528 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18528 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18528 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18528 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18528 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
P18528 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18528 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18528 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18528 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P18528 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18528 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18528 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18528 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18528 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18528 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18528 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18528 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18528 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18528 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18528 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18528 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18528 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18528 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18528 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18528 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18528 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18528 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18528 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18528 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18528 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18528 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18528 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18528 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18528 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18528 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18528 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18528 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18528 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18528 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18528 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18528 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18528 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18528 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18528 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18528 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18528 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18528 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18528 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18528 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18528 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18528 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18528 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18528 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18528 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18528 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18528 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18528 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18528 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18528 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18528 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18528 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18528 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18528 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18528 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18528 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18528 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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