Protein–RNA interactions for Protein: P07903

Ercc1, DNA excision repair protein ERCC-1, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc1P07903 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc1P07903 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms